Братство Макуты
Макута основал свое Братство, и в него вошли лишь существа равные ему по силе. Братство Макуты, как и он сам были призваны защищать маторанов.
Однако, по непонятным причинам, они изменились, стали набирать силу и власть. В их грандиозные планы входили – похищение Канохи Авокки, создание армии Висораков, Экзо-Тоа и Темных Охотников. Любимое занятие Братства, это создание мутаций, создание и формирование угодных им жизненных форм.
Слуги
Следующие рахи являются не членами Братства, а их слугами. Одни из них действуют по своей воле, а другие являются машинами, запрограммированными на подчинение Братству.
- Теневые Тоа. Призрачная часть Тоа, получившая физическую форму и способная отражать атаку своего оригинала. При этом  другие Тоа легко могут их поразить. На данное время встречались лишь двойники Тоа Мата (Олда).
- Ракши. Каждый участник Братства может сделать змеевидную Краату из своего тела. Любая краата может быть трансформирована в броню Ракши.
- Морбузак это растение, созданное Макутой чтобы переносить маторанов в центр Метру-Нуи. Королевский Корень находился в Великой Плавильне, так как Морбузак ненавидел холод.
- Орды Висораков. Ими управляли король Сидорак и его наместница Рудака (а также добрый Тоа Хордика Вакама). Висораки служили Братству Макуты главной военной силой. Но когда Вакама отдал приказ на освобождение, Висораки с радостью разошлись, тем более что Рудака предала их короля.
- Тоа Хага. Элита Тоа, служивших Братству телохранителями и поначалу не знавших об их истинных намерениях. Узнав правду, Тоа восстали против своих хозяев, и в наказание были превращены в Раага. Правда, перед этим они успели украсть Канохи Авокки из крепости Братства.
- Экзо-Тоа. Братство Макуты запрограммировало множество этих машин для собственной защиты. Тоа Хага уничтожили все, что смогли найти в армиях Братства и Темных Охотников.
Эти существа уже не слуги, они лишь имели некоторые связи с Братством. Сюда входит большинство их врагов и неудачных экспериментов.
- Темные Охотники. Братство Макуты и Темные Охотники когда-то имели дружественные отношения. Пока Макута не прибил двух из них в назидание другим. Война идет до сих пор.
- Карзахни это первая попытка Макуты создать разумное растение. Но он оказался настолько могущественным, что Макуте пришлось довольствоваться Морбузаком. Это не понравилось Карзахни, и он затаил зло на своего создателя. Вначале, его убило заряженным протодермисом, но позже он вырос снова, попав в море. Окончательно Карзахни уничтожил Макута, изолировав его от тепла и света.
- Ложные Бороки. Братство пыталось создать полностью механических Бороков, беспрекословно выполняющих их команды. Матораны-инженеры отошли от плана, и сделали Бороков полными психами. Этих психов с трудом победили Тоа Хага, а матораны были наказаны. В последствии, эти подделки получили название Фороки.
- Рудака. После роспуска армии Висораков, Рудака покинула Братство. А в войне между ними и Охотниками участвовала посредником.
Мутации
Братство Макуты известно благодаря созданию различных видов мутантов-рахи.
- Морбузак и Карзахни. Как описывалось выше, эти двое были созданы с целью похищения маторанов. У обоих сильно развито мышление и телепатические способности.
- Темные Охотники. Нанимая Охотников, Братство имело привычку расплачиваться за услуги всякими физическими изменениями или созданием рабов-рахи. Авак говорил, что своей способностью создавать из ничего неразрушимые ловушки он обязан Братству.
Созданные Братством мутанты:
- Краата-кал это Краата, заряженная той же самой энергией, что превратила Бороков в Бороков-кал. Краата-кал полноправный член Темных Охотников. Он контролирует стихии огня, воды и тени. Носит броню покруче брони Ракшей, вооружен огненным мечом с двумя лезвиями и дискометом Канока.
- Майнион – эксперимент над рахи, получивший разум без участия своих создателей. Чуть раньше, чем его передали в услужение Темным Охотникам, он сбежал во время восстания Тоа Хага. К сожалению, Майнион не мог, или не хотел выдавать секреты Братства.
- Рахи Нуи. Существо, подобно монстру Франкенштейна, собрано из деталей многих рахи. Изначально, он обладал восьмикратной Канока-энергией. Тысячу лет назад, Тоа Метру выступили против него и победили. Они увеличили его до невероятных размеров, так, что детали не выдержали, и он распался, предварительно серьезно поранив Тоа Нокаму.
Гораздо позже, Рахи Нуи был восстановлен Макутой, и сражался на этот раз с Тоа Нува (не обладая уже силой Канока). Закончилось все как в случае с Минотавром: рога Рахи Нуи застряли в стене.
- Вопорак. Сидорак сильно поднял расположение Братства, к себе предав предводителя своего клана на острове. Этот предводитель был захвачен и трансформирован в могучего Вопорака к дню создания Канохи Вахи, маски Времени. Вопорак способен ощущать временные аномалии там где они проявляются и таким образом обнаружить местонахождение Вахи. Когда Вакама использовал Вахи, Вопорак нашел её и отдал лидеру Темных Охотников, Затененному. Вопорак до сих пор служит Охотникам. Вместе с Охотником «Древним» они снова украли Вахи, после того как Тоа Таху воспользовался ей.
- Краатана. Гибрид краны и крааты. Странное рахи, прикрепляющееся к лицу и генерирующее предвидения. Тоа Онейва получил жуткий сон о Висораках. Позже, Тоа Вакама сумел связаться с Тоа Кракуа из будущего при помощи этого существа. Пока нет доказательств, что оно произошло от экспериментов Братства, но учитывая их интересы, это вполне возможно.

Макута основал свое Братство, и в него вошли лишь существа равные ему по силе. Братство Макуты, как и он сам были призваны защищать маторанов.
Однако, по непонятным причинам, они изменились, стали набирать силу и власть.